中心計劃目前為第二期 (2023-2027).  計劃分以下四個主題子計畫：

主題一：量子模擬與量子模擬器
以超導、半導體與冷原子為平台進行量子模擬，並發展將量子電腦所能處理的問題轉換為最佳化問題(理論)並發展以量子退火處理最佳化問題的量子模擬器。

召集人：林晏詳              副召集人：郭華丞、蕭子綱
協同研究人員：王道維、牟中瑜、陳正中、陳啟東、林瀚仚、溫秉彝、吳憲昌、徐碩鴻、張鑑元、邱奎霖、李定國、戴明鳳

 

主題二：衛星量子通訊與量子網路關鍵技術
發展以衛星為中繼之量子通訊以及量子網路的關鍵技術：量子記憶體、物質量子位元到光量子位元之轉換、時間同步以及頻率轉換。

召集人：褚志崧              副召集人：李哲明
協同研究人員：鐘楷閔、余怡德、陳應誠、陳泳帆、陳易馨

主題三：量子感測與計量學
發展量子計量與感測(單光子偵測器)並推進到測量解析極限超越海森堡極限(Heisenberg limit)。

召集人：李瑞光               副召集人：劉怡維
協同研究人員：林增耀、彭錦龍、王立邦、徐百嫻、陳明彰、朱創新

主題四：量子電腦架構精進與另類途徑( alternative approach)
精進現行超導量子位元(transmon或xmon) 的性質(decoherence time、超作時間、材料的成長界面品質精進等)並發展其他量子電腦架構的平台包括以馬約拉納費米子零能量態(zero mode of Majorana Fermion)為基礎之拓墣量子電腦：特別是發展能實現馬約拉納費米子零能量態所需的量子材料以及實現馬約拉納費米子之交換(braiding)以及離子阱量子電腦或模擬器。

召集人：徐斌睿               副召集人：童世光
協同研究人員：張銘顯、林育如、唐述中、霍夫曼、柯忠廷、李尚凡、郭瑞年、鄭弘泰、蘇雲良、林登松、李奕賢、徐有德